Serotipos vacunales y no vacunales de Streptococcus pneumoniae en niños de Latinoamérica: revisión del último reporte SIREVA II / Vaccine and non-vaccine serotypes of Streptococcus pneumoniae in children from Latin America: a review of the last SIREVA II report

Resumen Las infecciones por Streptococcus pneumoniae se encuentran dentro de las principales causas de muerte por enfermedades inmunoprevenibles en los niños menores de cinco años. Actualmente, existen vacunas conjugadas contra diversos serotipos de S. pneumoniae, por lo que su introducción ha sido una buena estrategia para la inmunización de la población en riesgo, además de contribuir indirectamente con la disminución de la resistencia antimicrobiana. Se realizó una revisión del último reporte disponible de los serotipos de S. pneumoniae circulantes en niños menores de cinco años residentes en Latinoamérica. Los serotipos vacunales 19A, 3, 14, 1 y no vacunal 12F, fueron los más frecuentes. En Latinoamérica la implementación de la vacuna PCV13 sigue siendo una excelente opción; sin embargo, con la introducción de las vacunas conjugadas se ha visto el fenómeno de enfermedad de reemplazo evidenciado con la circulación de diversidad de serotipos no vacunales. Es necesario realizar regularmente estudios epidemiológicos en los países latinoamericanos a fin de monitorear las estrategias de vacunación y el efecto de las vacunas conjugadas en la región.

Abstract Streptococcus pneumoniae infections are among the leading causes of death from vaccine-preventable diseases in children under the age of 5. There are currently conjugated vaccines against several S. pneumoniae serotypes, thus the introduction of this type of vaccine has been a good strategy for immunizing the population at risk, in addition to indirectly contributing to the decrease in antimicrobial resistance. A review of the last available report of circulating S. pneumoniae serotypes in children under five years of age residing in Latin America was performed. Vaccine serotypes 19A, 3, 14, 1 and non-vaccine serotype 12F were the most frequent. In Latin America the implementation of the PCV13 vaccine continues to be an excellent option; however, with the introduction of conjugate vaccines, the phenomenon of replacement disease has been evidenced by the circulation of diverse non-vaccine serotypes. Epidemiological studies in Latin American countries are necessary to monitor vaccination strategies and the effect of conjugate vaccines in the region.

Genes qnr en Enterobacteriaceae aisladas en un hospital de Venezuela / qnr genes in Enterobacteriaceae isolated from at a hospital in Venezuela

Resumen Introducción: La resistencia de enterobacterias a quinolonas se ha difundido por el mundo, fenómeno presente también en Venezuela. El mecanismo de esta resistencia pudiera estar mediado por genes incluidos en el cromosoma bacteriano o transmitirse en el interior de plásmidos. Objetivo: Evaluar la resistencia a quino-lonas, codificada por genes qnr, presentes en cepas de enterobacterias, aisladas en el Hospital Universitario de Cumaná, Venezuela. Métodos: A las cepas obtenidas se les realizaron pruebas de susceptibilidad antimicrobiana a quinolonas, β-lactámicos y aminoglucósidos. La presencia del gen qnr se determinó por RPC. Las enterobacterias portadoras del gen qnr fueron sometidas al proceso de conjugación bacteriana para comprobar su capacidad de transferencia. A las transconjugantes obtenidas se les realizó pruebas de susceptibilidad antimicrobiana y RPC para comprobar la transferencia de los genes. Resultados: Se encontraron elevados porcentajes de resistencia antimicrobiana a quinolonas y betalactámicos. El 33,6% de las cepas eran portadoras del gen qnrB, y 0,9% del gen qnrA. Se obtuvieron 23 cepas transconjugantes; de éstas, 20 portaban el gen qnrB, no se observó la presencia de qnrA. Discusión: En conclusión, el elevado porcentaje de genes qnr encontrado en las enterobacterias aisladas, y comprobada la presencia de éstos en plásmidos transferibles, complica la aplicación de tratamientos basados en quinolonas y fluoroquinolonas, por lo que es recomendable el uso racional de estos antimicrobianos, y proponer la rotación de la terapia antimicrobiana, a fin de evitar la selección de cepas resistentes.

Background: Enterobacteria resistant to quinolones is increasing worldwide, including Venezuela. The mechanism for this resistance could be due to genes included in the chromosome or in transmissible plasmids. Aim: To evaluate the resistance to quinolones, coded by qnr genes present in enterobacteria species, isolated in the University Hospital of Cumana, Venezuela. Methods: Antimicrobial susceptibility tests to quinolones, beta-lactams and aminoglycosides were carried out to all the isolates. The presence of qnr genes were determined by PCR. The isolates carrying the qnr genes were used for bacterial conjugation tests to determine the presence of transferable plasmids. Antimicrobial susceptibility tests and PCR were carried out in the transconjugants to verify the transfer of the genes. Results: High levels of antimicrobial resistance to quinolones and beta-lactams were found among the isolates. We found that 33.6% of the isolates carry the qnrB gene and 0.9% qnr A gene. Of the 23 transconjugants, 20 showed to have qnrB gene, but none qnrA. Discussion: We concluded that the high frequency of qnr genes found in the enterobacteria isolates and their presence on transferable plasmids, complicate the use of quinolones for the treatment of bacterial infections, thus, a treatment plan should be designed with the rational use and the rotation of different types of antimicrobials, in order to avoid the selection of increasingly resistant strains.

Molecular identification of multidrug resistant Enterobacter hormaechei in Venezuela / Identificación molecular de Enterobacter hormaechei multidrogoresistente en Venezuela

Besides the importance of Enterobacter cloacae species complex as a nosocomial pathogen, little is known about the frequency of each species/genotype. Here, we describe a strain of E. hormaechei subsp. hormaechei isolated from a bronchial secretion of a patient, in the Intensive Care Unit at the General Hospital of Cumaná, Venezuela, who died due to complications of his infection. The molecular identification was done by sequencing the 16S rRNA gene and comparing it to sequences from the GenBank. This strain showed resistance to multiple families of antibiotics (MDR), and the genes blaKPC and blaVIM were detected by PCR. This is the first time E. hormaechei has been identified in Venezuela.

A pesar de la importancia de las especies del complejo Enterobacter cloacae como patógeno nosocomial, poco se conoce sobre la frecuencia de cada especie/genotipo. Aquí se describe una cepa de E. hormaechei subsp. hormaechei aislada de una secreción bronquial de un paciente internado en la Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital General de Cumaná, Venezuela, quien murió producto de complicaciones de su infección. La identificación molecular fue hecha por secuenciación del gen ARNr 16S y porcomparación con las secuencias del GenBank. Esta cepa mostró resistencia a múltiples familias de antibióticos (MDR) y se detectaron los genes blaKPCyblaVIMpor PCR. Este es el primer reporte de E. hormaechei en Venezuela.

Relación clonal y detección del gen blaKPC en cepas de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenémicos, en un hospital de Venezuela / Clonal relationship and detection of blaKPC gene in strains of Klebsiella pneumoniae resistant to carbapenems, at a hospital in Venezuela

In order to study the clonal relationship and blaKPC gene detection in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae resistant to carbapenems, we analyzed 22 clinical isolates of K. pneumoniae with resistance to imipenem and/ or meropenem, isolated in the laboratory of bacteriology at the University Hospital "Antonio Patricio de Alcalá" (HUAPA) from the Cumana city, Sucre state, Venezuela, for a period of five consecutive years. Susceptibility to different antimicrobials was determined, and the presence of carbapenemases was detected by modified Hodge method, phenyl boronic acid synergy and combination discs. blaKPC gene detection was conducted by polymerase chain reaction and the clonal relationship was determined by pulsed field electrophoresis. High rates of antimicrobial resistance were found, five strains were negative, at least one phenotypic method, and all carried the blaKPC gene. Clonal spread was observed only in the intensive care unit (ICU), while in other services, polyclonality was found. We concluded that blaKPC gene is present in K. pneumoniae strains resistant to carbapenems isolated in the HUAPA and clonal spread it was only in the ICU.

Con el objetivo de estudiar la relación clonal y detección del gen blaKPC en aislados clínicos de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenémicos, se analizaron 22 cepas clínicas de K. pneumoniae con resistencia a imipenem y/o meropenem, aisladas en el laboratorio de bacteriología del Hospital Universitario "Antonio patricio de Alcalá" (HUAPA) de la ciudad de cumaná, Estado Sucre, Venezuela, durante un período de cinco años continuos. Se determinó la susceptibilidad a diversos antimicrobianos, y se detectó la presencia de carbapenemasas por los métodos de Hodge modificado, sinergia con ácido fenil borónico y combinación de discos. La detección del gen blaKPC se llevó a cabo mediante la técnica de reacción de polimerasa en cadena y la determinación de la relación clonal se realizó por electroforesis de campo pulsado. Se encontraron elevados porcentajes de resistencia antimicrobiana, cinco cepas resultaron negativas, al menos, a un método fenotípico y todas portaban el gen blaKPC. Se observó diseminación de clones únicamente en la Unidad de cuidados Intensivos (UCI), mientras que, en otros servicios, se halló policlonalidad. Se concluye que el gen blaKPC se encuentra presente en cepas de K. pneumoniae resistentes a carbapenémicos aisladas en el HUAPA y que hubo diseminación clonal sólo en UCI.

KPC and VIM producing Enterobacter cloacae strain from a Hospital in Northeastern Venezuela / Enterobacter cloacae productor de KPC y VIM en un Hospital del Noreste de Venezuela

An 83-year-old male patient is admitted to the central hospital in Cumaná, Venezuela with severe urinary infection, history of hospitalizations and prolonged antimicrobial treatments. A strain of Enterobacter cloacae was isolated showing resistance to multiple types of antibiotics (only sensitive to gentamicin), with phenotype of serine- and metallo-carbapenemases. Both, blaVIM-2 and blaKPC genes were detected in the isolate. This is the first report of an Enterobacteriaceae species producing both KPC carbapenemase and VIM metallo carbapenemase in Venezuela. This finding has a great clinical and epidemiological impact in the region, because of the feasibility of transferring these genes, through mobile elements to other strains of Enterobacter and to other infection-causing species of bacteria.

En un paciente masculino de 83 años, que ingresó al Hospital de Cumaná, Venezuela, con diagnóstico de infección urinaria severa, antecedentes de hospitalización y diferentes tratamientos antimicrobianos durante largos periodos de tiempo, se aisló una cepa de Enterobacter cloacae, la cual evidenció resistencia a múltiples tipos de antibióticos (solo sensible a gentamicina) y con fenotipo de carbapenemasas de tipo serina y metalobetalactamasa. Los genes blaVIM-2 y blaKPC fueron detectados en esta cepa. Este representa el primer reporte de una especie de Enterobacteriaceae productora simultánea de carbapenemasa KPC y metalobetalactamasa VIM en Venezuela. Esto tiene un gran impacto clínico y epidemiológico en la región por la posibilidad de transferencia de estos genes a otras cepas de Enterobacter u otras especies bacterianas causantes de infecciones, por medio de elementos móviles.

FIRST REPORT OF METALLO-β-LACTAMASES PRODUCING Enterobacter spp. STRAINS FROM VENEZUELA / Primer reporte de cepas de Enterobacter spp productoras de metalobetalactamasas de Venezuela

Clinical strains of Enterobacter were isolated from Cumana's Central Hospital in Venezuela, and classified as E. cloacae (21), E. aerogenes (7), E. intermedium (1), E. sakazakii (1) and three unclassified. The strains showed high levels of resistance, especially to SXT (58.1%), CRO (48.8%), CAZ (46.6%), PIP (46.4%), CIP (45.2%) and ATM (43.3%). This is the first report for South America of blaVIM-2 in two E. cloacae and one Enterobacter sp., which also showed multiple mechanisms of resistance. Both E. cloacae showed blaTEM-1, but only one showed blaCTX-M-15 gene, while no blaSHV was detected.

Cepas clínicas de Enterobacter fueron aisladas del Hospital central de Cumaná en Venezuela, y se clasificaron como E. cloacae (21), E. aerogenes (7), E. intermedium (1), E. sakazakii (1) y 3 sin clasificar. Las cepas mostraron altos niveles de resistencia, especialmente a SXT (58.1%), CRO (48.8%), CAZ (46.6%), PIP (46.4%), CIP (45.2%) and ATM (43.3%). Este es el primer reporte de América del Sur de blaVIM-2 en dos cepas de E. cloacae y una de Enterobacter sp., las cuales también mostraron múltiples mecanismos de resistencia. Ambas especies de E. cloacae mostraron genes blaTEM-1, pero solo una mostro el gen blaCTX-M-15, mientras que blaSHV no fue detectado.

Diseminación de enterobacterias productoras de carbapenemasas tipo KCP en Venezuela / Spread of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae type KCP in Venezuela

La resistencia a carbapenems en la familia Enterobacteriaceae constituye un problema creciente a nivel mundial, siendo el mecanismo de mayor impacto clínico, epidemiológico y microbiológico, la producción de serino-carbapenemasas KPC. Investigar la presencia de carbapenemasas tipo KPC en aislados de Enterobacterias resistentes a carbapenems, provenientes de diversos centros de salud a nivel nacional, durante el período mayo 2010 - junio 2011. En esta investigación se analizaron 91 aislados de Enterobacterias: K pneumoniae (48), E. cloacae (30), E. aerogenes (4), E. coli (2), C. koseri (1), C. freundil (6), con resistencia a carbapenems provenientes de 14 centros de salud. La susceptibilidad antimicrobiana se evaluó siguiendo los criterios de la CLSI 2011. La detección fenotípica de carbapenemasas se realizó mediante el test de Hodge modificado y evaluando la sinergia con el ácido 3-aminofenilborónico 300 µg/disco. Se realizó el Test de Hodge "doble modificado" a los aislados de Enterobacter y Citrobacter. La detección genotípica de carbapenemasas se llevó a cabo mediante PCR utilizando iniciadores para el gen blaKPC. Todos los aislados presentaron a los deinhibición < 22 mm para meropenem y ertapenem. El 95% de los aislados resultaron positivos para el test de Hogde modificado, el test con ácido borónico, y para el gen blaKPC. En el test de Hodge "doble modificado", se observó 100% de positividad. La resistencia a carbapenems mediada por Carbapenemasas KPC, se ha incrementado en los últimos años en el país y el carácter plasmídico de estas enzimas les permite su fácil diseminación entre diversos géneros de Enterobacterias.

Resistance to carbapenems is the family Enterobacteriaceae is a growing problem around the world, being production of KPC serino-carbapenemase, the mayor impact clinical, epidemiological and microbiological mechanism. To investigate the presence of KPC carbapenemases in isolates of Enterobacterias resistant to carbapenems, from various health centers nationwide, during the period May-2010 June 2011. In this study were analyzed 91 Enterobacterias isolates: K. pneumoniae (48), E. cloacae (30), E. aerogenes (4), E. coli (2), C. koseri (1), C. freundii (6), with resistance to carbapenems from 14 health centers. Antimicrobial susceptibility was evaluated according to the criteria of the CLSI 2011. Phenotypic detection of carbapenemases was performed by Modified Hodge Test and it was evaluated the synergy with the 3-aminophenylboronic 300 µg/disc. Test were done with "double Modified" Hodge to Enterobacter and Citrobacter isolates. Genotypic detection of carbapenemases was performed out by using PCR primers for the gene blaKPC. All isolated showed inhibition zones <22 mm for meropenem and ertapemen. The 95% of the isolates were positive for Hogde Modified Test, test with boronic acid, and to blaKPC gene. By performing "Double Modified" Hodge`s essay , we observed a 100% of positivity. Resistance to carbapenems mediated by KPC carbapenemases has increased in the last few years in the country, and plasmidic characterization of these enzymes allows easily dissemination among different genera of Enterobacteriaceae.